Pour assumer sa mission, l’exécutif de la Communauté Francophone Catholique de Kampala (CFCK) s’appuie sur six commissions correspondant aux domaines ci-après :
Liturgie

La commission chargée de la Liturgie coordonne toute activité et tout service relatifs à la liturgie. De ce fait il encadre les organisations suivantes :
- Chorales
- Servants de Messe
- Lectorat
- Gardes de paix
Pastorale

Le service de la Commission pastorale de la CFCK est aussi bien inclusif qu’intégral, saisissant presque tous les domaines de la pastorale de l’Église, dont :
- Les enfants et la jeunesse
- Les couples et la famille
- Les mamans
- Les mouvements d’action etc.
Catéchèse

La commission chargée de la catéchèse prépare des candidats aux sacrements et assure le suivi de l’affermissement des chrétiens. Les domaines récurrents sont :
- Le Baptême
- La Première Communion
- La Confirmation
- Le Mariage
Social

La commission chargée du Social s’occupe des cas sociaux divers, stimulant la communion fraternelle aux moments de peines et de joie. Ses services affermissent la solidarité et l’amour au sein de la communauté.
Justice & Paix

La commission Justice et paix aide les frères et sœurs à se maintenir dans un climat d’harmonie et de fraternité, en dépit des chocs inévitables là où deux personnes se retrouvent ensemble. Elle aide à la réconciliation.
Economie

La commission Économie se rapporte à aux questions du fonctionnement financier. Elle suppose que la communauté devrait se constituer une caisse centrale pouvant subvenir aux besoins pastoraux à caractère collectif.
CFCK – La joie de partager la communion fraternelle en Christ !